纯生信分析鉴定胃癌发病机制和预后相关基因：发4分

今天给大家解读一篇利用纯生信整合分析的技术路线，该文发表在2018年7月17日发表的Front. Genet（影响因子4.151）上，基本思路是通过一系列的生物信息分析的方法挖掘胃癌预后相关的潜在标志物。该研究的结果为进一步研究诊断和预后生物标志物以及促进GC的分子靶向治疗提供了一些指导意义。

我们先来看一下基本的分析流程：

具体步骤：

筛选多套GEO数据集，筛选标准：人类胃组织样本；包含对照组；每套至少10例样本；

TCGA数据集：从癌症基因组图谱（TCGA）获得含有375个GC样品和32个匹配的癌旁样品的RNA-Seq数据。

4.差异基因分析

5.差异基因富集分析

6.PPI网络互作分析

7.DEG(差异表达基因)预后分析

8.高低风险组的表达差异分析图

好了，完事儿了，4分到手

原创： 猪师兄 弗雷赛斯