006-CCA与RDA分析
2017-03-11 本文已影响170人
quan575
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http://www.qplot.cn:3838/apps/006-CCA_RDA/
RDA分析(Redundancy analysis)，即冗余分析，对比主成分分析可以发现，其实冗余分析就是约束化的主成分分析。
RDA或CCA的选择问题：RDA是基于线性模型，CCA是基于单峰模型。一般我们会选择CCA来做直接梯度分析。但是如果CCA排序的效果不太好，就可以考虑是不是用RDA分析。RDA或CCA选择原则：先用species-sample资料做DCA分析，看分析结果中Lengths of gradient 的第一轴的大小，如果大于4.0，就应该选CCA，如果3.0-4.0之间，选RDA和CCA均可，如果小于3.0, RDA的结果要好于CCA。
RDA.png
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