推荐一份生物信息学、群体遗传学入门学习的参考资料
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小明的数据分析笔记本
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https://wurmlab.github.io/genomicscourse/2016-SIB/practicals/
image.png主要内容
image.png- 二代测序数据清洗
- 基因组组装
- 组装质量评估
- 基因预测
- 检查注释质量
种群基因组相关的内容
- 序列比对
- 变异检测
- 变异检测结果可视化
- 主成分分析
- 评估种群差异和多样性
- 推断种群大小和基因流
转录组数据
- 计算表达量
- 表达量聚类和差异表达分析
争取将这些内容都重复一遍,并整理笔记发布到公众号
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