统计学

相关分析

2020-03-03  本文已影响0人  生信F3

1 相关关系

相关关系指变量之间存在着非确定性依存关系。即当一个或一组变量每取一个值时,相应的另一个变量可能有多个不同值与之对应。
——相关关系可以理解为多个变量均值之间的一种数量关系!

1.1 相关关系的种类

按变量的个数分类:

1.2 相关分析的特点

  1. 两个变量全是随机变量,X是随机变量,Y也是随机变量;
  2. 变量X与变量Y只能计算出一个相关系数,相关系数是唯一的;
  3. 计算相关系数时,变量X与Y获取的资料方式相同。

2 相关性度量

2.1 相关系数

对变量之间关系密切程度的度量

若相关系数是根据总体全部数据计算的,称为总体相关系数,记为 \rho。若是根据样本数据计算的,则称为样本相关系数, 记为 r。

根据数值大小来判定相关密切程度方面,尚无一致意见。一般常划分为四级:|r| 数值在0.3以下者视为不相关,0.3~0.5属低度相关,0.5-0.8属显著相关,0.8以上属高度相关(仅供参考,需根据实际情况判断)。

为了定量的描述线性相关性,统计学奠基人K. Pearson提出了Pearson积差相关系数、心理学家CE. Spearman提出了Spearman等级相关系数、统计学家M. Kendall提出了Kendall秩相关系数。这三种相关系数最具有代表性、应用也最广泛,它们既有联系又有不同,分别有不同的适用场景。

重要参考: 作者:Treant;出处:http://www.cnblogs.com/en-heng/

2.1.1 Pearson相关系数

Pearson相关系数 (Pearson correlation coefficient)用于度量两个变量X、Y的相关性,定义如下:
r=\frac{\sigma_{XY}}{\sigma_X\sigma_Y} =\frac{\sum_{i=1}^n (X_i-\overline{X}) (Y_i-\overline{Y})}{\sqrt{\sum_{i}^n(X_i-\overline{X})^2} \sqrt{\sum_{i}^n(Y_i-\overline{Y})^2}}上述公式又被称为相关系数的积差法计算公式,其中分子位置的 \sigma_{XY} 表示变量X与Y的协方差(消除了变量个数的影响),分母位置的两变量的标准差 \sigma_X,\sigma_Y 的作用是使不同变量的协方差标准化,用于消除变量本身数值大小的影响。

!注意:

下图给出了当Pearson相关系数为不同值时X和Y的散点图(以下三张图片均来自于Wikipedia):

不同相关系数散点图

2.1.2 Spearman相关系数

Spearman相关系数实际上就是将变量X和Y替换成其对应等级x, y的Pearson相关系数:
\rho = \frac{\sum_{i=1} (x_i - \overline{x}) (y_i - \overline{y})}{\sqrt{\sum_{i}(x_i - \overline{x})^2} \sqrt{\sum_{i}(y_i - \overline{y})^2}}相较于Pearson相关系数,Spearman相关系数更能描述两个变量之间的单调性的相关性,对于样本中的显著离群点更为不敏感。比如,下图中变量X和Y的Pearson相关系数、Spear-man相关系数分别为0.88与1,显然Spearman相关系数更好地刻画了两个变量增长趋势的相关性。

下图更好地表现出了Spearman相关系数的抗噪音性:

2.1.3 Kendall相关系数

Kendall相关系数是另一种等级相关统计量,其主要思想是根据两个变量序对的一致性 (concordance)来判断相关性的。一致性序对 (concordant pair)定义如下:如果变量对(X_i, Y_i)(X_j, Y_j)i \neq j 满足当X_i < X_jY_i < Y_j,或者当X_i > X_jY_i > Y_j。反之,则为非一致性序对。

Kendall相关系数的定义如下:
\tau = \frac{P - Q}{n(n-1)/2}其中,P为一致性序对的个数,Q为非一致性序对个数,则P+Q=n(n−1/2),因此上式可改写为:\tau = \frac{4P}{n(n-1)/2} -1, 显然τ的取值范围为[-1, 1] 。

2.2 线性相关的假设检验

基本步骤:

  1. 提出原假设与备择假设 ,H_0:\rho=0,H_1:\rho\neq0
  2. 给定显著性水平 \alpha
  3. 选择检验方法,构建检验统计量
  4. 将检验统计量与临界值比较,如检验统计量的绝对值大于临界值,则拒绝原假设,否则,就不拒绝原假设。

检验方法:

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