一、KEGG分析

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通过这篇文章上的网站进行小麦的KEGG分析
Home - Plant Reactome Pathway Database (gramene.org)

1）点击analyze data

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2）粘贴自己的基因名称数据

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3）提交数据并进行分析

4）查看mapping到的基因，下载基因名称

5）将mapping基因重新粘贴提交后进行分析下载result

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二、网页版GO分析

小麦网页版的GO分析有很多网址，这次主要示范中国农业大学的孙其信老师团队郭伟龙老师公布的网站

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TriticeaeGeneTribe - A homology database for Triticeae tribe (wheat, durum wheat, barley, and their relatives) (cau.edu.cn)
由于该网站应该是挂在学校的服务器下边，导致有时候国家开会等事情访问会受限。包括其中agrigo经常打不开也是因为这个问题。

1）点击GOenrichment

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2）在2粘贴自己数据后点击3GO进行分析，得到结果后直接下载成CSV

以上KEGG和GO结果只是展示的最终表的形式，可以帮助查看自己的目标基因所在的KEGG和GO所在的term，需要自己按照自己的需求画图。比较了网页分析的KEGG和GO的结果，较大的避免了之前用emapper自己构建后进行分析发现大量的跟植物不相关的GOterm 和KEGG 的pathway。