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肿瘤的临床指标异质性

2019-04-03  本文已影响17人  因地制宜的生信达人

肿瘤的临床指标异质性

关于肿瘤内部异质性的讨论,我们介绍了很多:

而且探索肿瘤内部异质性的技术也很多:

今天要介绍的研究也是多位点取样流派,但是呢,并没有采用NGS技术,也没看芯片检测,仅仅是临床指标的探索

发表于 Oncologist. 2017 Apr; 的文章:Intratumoral Heterogeneity in Breast Cancer: A Comparison of Primary and Metastatic Breast Cancers 深度解析了不同的临床指标在乳腺癌患者的异质性问题。

使用immunohistochemical (IHC) 技术,主要检测的指标是:

每个区域取样超过30个:Multiple regions (>30 regions per case totally) from the primary and paired metastatic tumors were randomly selected from digitally captured IHC images.

计算了 Shannon index 和 Rao's quadratic entropy

很明显的异质性

比如:regions showing HER2 IHC3+ were noted for primary T1 and T4 tumors, which were classified as HER2 negative

还有:for ER‐negative T3 and T7 tumors, regional ER expression could be observed.

也就是说如果不同的临床医生对病人的肿瘤取不同地方取做检测,是会得到不同的检测结果,这样的检测结果就指导了不同的治疗策略。

比如,约15%-20%的乳腺癌患者会表现为雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)及表皮生长因子受体(HER2)均为阴性,称之为三阴性乳腺癌(TNBC),相当一部分三阴性乳腺癌患者伴有乳腺癌易感基因BRCA突变,直至2018年1月12日,FDA批准聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(Poly ADP-ribose Polymerase,PARP)抑制剂奥拉帕利(Olaparib)用于BRCA基因突变的HER2阴性的转移性乳腺癌,开启了乳腺癌靶向治疗的另一片天地。

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