conda装好软件后库文件缺失问题

2023-09-14  本文已影响0人  pudding815

在学校服务器上conda安装软件后

$conda install -y bowtie2
$bowtie2
$libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.11' not found

提示安装成功
但是bowtie2报错缺失库文件


image.png

由于我是非root用户,权限受限
在两位老师@exps和@wandering大佬的指导下解决了这个问题

1、第一步查看服务器上是不是有缺失的这个文件

$strings /usr/lib64/libstdc++.so.6|grep CXXABI
#如下图主目录下有

第二步找到自己环境下的lib路径

其实就是在自己conda环境的lib里
其实报错的时候就告诉你哪里缺少这个文件了(见图一画红线的地址)

第三步 缺什么补什么 复制过去

$cp /usr/lib64/libstdc++.so.6 /work/home/algroup01/software/mini/envs/RNA/lib

使用bowtie2 --help 正确出使用说明啦

ps感谢@exps和@wandering及小杜老师@小杜的生信笔记

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