肿瘤纯度
http://www.bio-info-trainee.com/3513.html
DEseq进行差异分析
http://www.bio-info-trainee.com/bioconductor_China/software/DESeq2.html
Mutat2# 终于看到了一个完整的mutect2使用脚本

http://www.bio-info-trainee.com/3386.html
GATK4的mutect2流程
http://www.bio-info-trainee.com/3359.html
这可能是最易于理解的肿瘤异质性参考资料了
http://www.bio-info-trainee.com/3282.html

使用ESTIMATE来根据stromal和immune细胞比例估算肿瘤纯度

http://www.bio-info-trainee.com/3253.html

使用cnvkit来对大批量wes样本找cnv
http://www.bio-info-trainee.com/2859.html