lncRNA受SNP调控的数据库
单核苷酸多态的变化，可以影响基因的的调控。而如果SNP的变化可以影响lncRNA的调控。lncRNASNP2(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP#!/)就是一个来预测SNP对于lncRNA调控的数据库。
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lncRNASNP2数据库是一个可以检索在lncRNA上发生的单核苷酸突变的数据库。目前该数据库支持两个物种：人和老鼠。该数据库主要可以用来：
- 预测lncRNA中的SNP对于其本身基因的影响；
- miRNA在lncRNA中的结合和SNP对结合的影响;
- TCGA癌症中lncRNA的突变情况以及lncRNA的表达情况
- COSMIC数据库（癌症相关体细胞突变位点的最大的数据库之一）中的关于lncRNA的结果
- 预测突变对于lncRNA的影响
使用方法：
在检索栏中检索：snp号; lncRNA；甚至可是以 mirRNA。
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结果展示：
SNP为检索目标
这里我们输入最基本的rs2851来进行结果展示。我们在输入SNP后。可以得到下图的一个界面
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在结果当中，我们可以看到该SNP的详细信息。已经这个SNP时候会产生其他影响。详细结果的展示可以总每个选项里面呈现。这里包括四种结果。
- SNP在lncRNA当中的位置。
PS:这里的lncRNA的ID是来自于NONCODE数据库的ID号。
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- SNP是否是tagSNP
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- SNP的改变增加了哪些miRNA的结合
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另外如果我们点击 show则可以显示具体的调控结果：
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- 既然有了增加情况，那肯定也会有减少情况的：
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同样的点击 show可以显示具体的调控结果
lncRNA为检索目标
lncRNA检索的时候。需要注意的是，我们如果直接输入想要研究的genesymbol的话。可能得不到自己想要的结果。需要先去 NONCODE数据库找到相对应的ID号才既可以检索。这里我们选择 MIAT（NONHSAT192181.1）来展示结果
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在检索结果的详细结果当中我们可以得到，有多少个SNP，以及SNP的变化可以影响多少个miRNA的改变。
除了关于lncRNA的总体结果。在各个小部分里面，我们也可以看到。详细的信息。其中也包括：该lncRNA和疾病的关系以及lncRNA在TCGA数据库中的表达情况。
PS：如果这个数据库可以用SNP的变化和基因表达的影响关系的分析那就就更好了。当然。没有的话，也可以自己做的嘛
结果下载
网页数据库对于检索单一位点或者lncRNA还是很方便的。但是如果是多基因的话。就很浪费时间了。这样数据下载界面就可以用到了。同样的在这个数据库。我们可以得到基本上所有的数据的结果。
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