肿瘤中X分子与其预后的分析结果（一）

最近需要可视化不同亚型，不同分期癌症中X分子的高表达与低表达与患者预后的关系。下面主要是两种方法。

如果分析的数据来源于GEO，有一个很好用的在线网页（KMplotter，http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background）可以进行乳腺癌，肺癌，卵巢癌， 胃癌，肝癌等癌种中基因与预后关系的结果分析。如下图所示：

1. 选择需要的癌种（以乳腺癌为例）

选择乳腺癌

2.进行分子的输入以及参数的设置，

图1 1，进行目标分子的输入，有些分子可能对应多个探针，可以根据需要多测试几个。2，患者分组设置，median表示根据表达从中间分。3，选择需要分析的预后类型（OS,DMFS,RFS,PPS）。4，选择随访时间，可根据需要选择也可以不选择，默认所有。5，选择探针的类型，可以根据推荐选择最佳也可以用自己选择的，圆圈里显示选择条件下的患者人数。

图1 设置第一部分

图2 此处可以进行生成图片形式的设置，export plot data as text可以进行数据的下载。

图2 设置第二部分

图3 此处进行亚型、分期、分级，放化疗的相关设置。

图3  设置第三部分

图4 分析结果图，P值为显著性.HR为风险值，HR>1,bad prognostic factor,HR<1,good prognostic factor.

图4 结果图