推荐一个快速绘制热图的在线工具
为了争夺“5G”，美国接连针对中国通信公司。去年4月16日，美国商务部公布对中兴制裁，折腾了4个多月，交了14亿美元保护费后才罢手。接着，开始着手搞华为，最近两天，谷歌暂停支持华为部分业务……
其实，OmicShare最近也在持续经受网络攻击，导致很多用户都不能正常访问OmicSahre论坛。针对幕后黑手，我想说有这时间和精力为什么不提高自己的业务能力，选择要走邪路呢？只会窝里横，有本事搞美国企业去？
言归正传，今天给大家介绍一个简单易上手的在线热图绘制工具，它是OmicShare tools中最受欢迎的工具，上线不到两年，目前已有近100多篇SCI文章引用。
工具网址：http://www.omicshare.com/tools/
表达量热图绘制
数据准备
先把数据准备好，数据可以是gene的表达量数据、物种的丰度数据等。你可以对表格做些自定义筛选和整理，也可以直接使用结题报告给的表达量总表而不做整理。这里的范例数据是用Excel 整理的9个样本、30个gene（表达量TOP30）的表达量表格。
注意，最后把Excel中整理好的文件另存为“制表符分隔的”txt文件，如下图，OmicShare和几乎所有的生信在线工具一样不支持Excel格式。另外表格中不要出现中文、空格、特殊符号比如（）、？、*、[ ]、$等等。
参数设置
接下来将表达量数据上传到我的数据，方法如下：
在我的软件中找到“热图”工具，如下图，然后进入工具页面。
任务编号会随机生成，点绿色的选择文件按钮，选择刚才上传到云端的表达量表格。当然你可以直接点浏览本地文件按钮，用本地文件做分析，只不过每次用该数据分析时都需要上传一遍。
数据选择，这里选1-10列（所有列，包括行名），使用前31行（包括列名）数据作图；数据按行做归一化，并对行和列经行聚类；然后自定颜色为“蓝白黄”渐变；热图格子的长度和高度，这里不填写，默认为自适应画布，最后，将格子的“边框（边界）”设为显示。
点击蓝色的提交按钮，会自动跳转到我的任务页面，大约10多秒左右刷新任务即可，然后下载作图结果。文件预览按钮仅仅用作查看作图是否成功，图表比例可能被拉伸，最终的绘图效果以下载文件结果为准。若没有图，可点运行信息按钮查看报错信息。
绘制效果如下：
相关性热图绘制
数据准备
数据是gene的表达量数据的相关性系数矩阵，也可以是距离矩阵。
需要注意一点，如果数据是R语言导出的矩阵，需要给矩阵左上角的“空白”填上数值，如下图添加的“sample”，使第一行（列名）和第二行的数据个数相同，否则，运行会出错，没有结果。同样，要把Excel中整理好的文件另存为“制表符分隔的”txt文件，然后上传到我的数据。
参数设置
数据的选择同上，这里选1-10列（所有列，包括行名），使用前10行（包括列名）数据作图；数据不需要做归一化，也不需要对行和列经行聚类；然后自定颜色为“蓝白黄”渐变；热图格子的长度和高度这里都输入30，使格子成为“正方形”；并在格子中显示数据，也将格子的“边框（边界）”设为显示，如下图。
下载结果
刷新任务后，下载作图结果，最终效果如下：
这是Omicshare tools系列教程介绍的第三个工具，对GO和KEGG富集分析感兴趣也可查看这篇《如何轻松完成GO、KEGG富集分析》。今天的内容就到这里啦~
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