【生信】记录我的一些问题
2020-05-22 本文已影响0人
虫虫工工队
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我是自学生信的,问题可能非常简单,只是自己做个记录,欢迎交流
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Q:为什么蛋白质fasta格式序列上的description都写明蛋白是一个什么蛋白了,还要对蛋白质做结构域搜索?不是直接搜名字搜到我想要的蛋白就行了吗?
A:我看有的蛋白搜索出来是hypothetical protein,其实具体功能可能还不知道,但是通过做结构域搜索,比如拿萜类环化酶结构域去搜索得到这一个hypothetical protein,就说明这个未知功能的蛋白可能可以参与萜类环化的反应。