学习小组DAY5-振华

数据结构

数据集

通常是由数据构成的一个矩形数组，行表示观测，列表示变量。R中有许多存储数据的结构，包括标量、向量、数组、数据框和列表，多样化的列表赋予R极其灵活的数据处理能力。

向量

• 向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。a为数值型向量，b为字符型向量，c为逻辑型向量，单个向量中的数据必须拥有相同的类型和模式。

> a <- c(1,2,5,3,6,-2,4)
> b <- c("one","two","three")
> c <- c(TRUE,TRUE,TRUE,FALSE,TRUE,FALSE)

• 通过在方括号中给定元素所处位置的数值，我们可以提取向量中的元素

> a <- c("k","g","h","a","c","m")
> a[3]   第三个元素
[1] "h"
> a [c(1,3,5)]
[1] "k" "h" "c" 第1,3,5个元素
> a[2:6]
[1] "g" "h" "a" "c" "m" 第2~6个元素
> a [-3]
[1] "k" "g" "a" "c" "m" 除了第3个元素

也可通过值的大小提取元素

> a <- c(1,2,5,3,6,-2,4)
> a[a<2]
[1]  1 -2
> a[a==2]
[1] 2
> a[a %in% c(1,2,5,3,6,-2,4)]
[1]  1  2  5  3  6 -2  4

数据框

• 不同的列包含不同的模式（数值型、字符型等）的数据。数据框可通过data.frame?()创建

> patientID <- c(1,2,3,4)
> age <- c(25,34,28,52)
> diabates <- c("Type1","Type2","Type1","Type1")
> status <- c("poor","Improve","Excellent","poor")
> patientdata <- data.frame(patientID,age,diabates,status)
> patientdata <- data.frame(patientID, age, diabates, status)
> patientdata
  patientID age diabates    status
1         1  25    Type1      poor
2         2  34    Type2   Improve
3         3  28    Type1 Excellent
4         4  52    Type1      poor

• 选取数据框中的元素

数据导入

• 使用read.table()从文本文件中导入数据。此函数可读入一个表格格式的文件并将其保存为一个数据框。
• 逗号分隔文件（.csv文件）、制表符分隔文件（.tsv文件）和空格分隔文件（.txt文件）
• 读取本地数据，read.table(file="huahua.txt",sep = "\t",header = T)
• 函数选项
  • header 表示文件是否第一行包含了变量名的逻辑型变量
  • sep 分开数据值的的分隔符
  • row.names 用于指定一个或多个行标记符的可选参数
  • col.names 如果数据文件的第一行不包括变量名，可以用col.names去指定一个包含变量名的字符向量。
  • X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1),修改第一列为行名
  • write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)数据导出
  • save.image(file="bioinfoplanet.RData")保存当前所有变量
  • save(X,file="test.RData")保存其中一个变量
  • load("test.RData")再次使用RData时的加载命令```
• 把文本文件存放在工作目录下不然会报错

提取元素

• [x,y]第x行第y列

• [x,]第x行
• [,y]第y列
• x[y]也是第y列
• [a:b]第a列到第b列
• [c(a,b)]第a列和第b列

save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？

• 第一种可能是不存在，第二种保存时可能输入法不对，大小写或者中文输入法，改写大小写。