单细胞打分-scgmt
2024-07-28 本文已影响0人
oceanandshore
先说结论:首推UCell、其次是AddModuleScore.
考虑到单细胞打分的情况,最理想的状态应该是一种运行时间快、计算资源消耗小,不受seed和纳入细胞数的影响(即每个细胞打分是相对独立的),此外最好能适配seurat的对象。目前适配seurat对象的方法是UCell和AddModuleScore。
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同样是这个老哥,把这些打分软件集成在一起了。