用Python读取FASTA格式的多序列文件,并把特定物种的相关

2022-10-10  本文已影响0人  懒猪曼达

输入文件的格式假定如下:

>sp |PO3372| ESR1_HUMAN Estrogen receptor OS = Homo sapiens

HVESDKVPVASIHATLNGPGSIRITWSN...

>sp |PO3472| ESR1_HUMAN Estrogen receptor OS = Homo sapiens

HVESDKVPVASIHATLNGPGSIRITWSNP...

>sp |PO3672| ESR1_HUMAN Estrogen receptor OS = Amphimedon queenslandica

VASIHATLNGPGSIRITWSNPVKPNGLIIHY...

代码实例及输出结果展示:

思路流程图:

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