推荐一份系统发育分析的教程

对应的github主页 https://github.com/mmatschiner/tutorials

主要内容包括

• 序列比对

• 模型选择

• 最大似然树

• 最大简约树

• 分歧时间推断

• 物种树的构建

• 利用snp数据构建物种树

• 利用snp数据推断分歧时间

• 利用snp数据分析杂交和渗入

内容挺全面的，数据和分析过程用到的代码都是公开的，很好的学习素材

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小明的数据分析笔记本