06.如何选取数据集
2019-06-03 本文已影响0人
大肥口水垫
选取什么样的变异位点？
| name | 111 | 222 | 333 | 444 |
|---|---|---|---|---|
| aaa | bbb | ccc | ddd | eee |
| fff | ggg | hhh | iii | 000 |
- 根据项目的目的，我们需要探索的其实是SNP之间的关联，落在什么通路上。
Hugo_Symbol Entrez_Gene_Id Center NCBI_Build Chromosome Start_Position End_Position Strand Variant_Classification Variant_Type
TEKT4 150483 BI GRCh38 chr2 94876716 94876716 + Missense_Mutation SNP A A G
TKTL2 84076 BI GRCh38 chr4 163473615 163473615 + Silent SNP C C T
MIR8078 102466878 BI GRCh38 chr18 109358 109358 + 3'Flank SNP T T C
FLT3 2322 BI GRCh38 chr13 28028203 28028203 + Missense_Mutation SNP G G T
TMEM119 338773 BI GRCh38 chr12 108592157 108592157 + Frame_Shift_Del DEL C C -
