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高颜值的相关性计算工具——你爱了吗!

2020-07-09  本文已影响0人  生信学霸

相关性基础知识

“ 相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数 ”

“ 每日一叨 ”

前段时间给大家介绍了很多小工具的使用方法,很多小伙伴给小编反映,说他们属于编程小白,对于生信分析更是渴望而不可及的事,但是通过这些小工具,可以实现一些简单的生信分析,甚至比较难的图也很容易就出来了。

而有些小伙伴反而最简单的图都做不出来,这是为什么呢?

这个问题在云平台中显得尤为重要,有些好数据做出来的图高颜值,而有些杂乱数据甚至导不出来图

因为做数据分析最关键的地方在于数据本身,是对数据进行预处理和标准化,这样才能保证后面有正确的结果。

背景介绍

在生物信息领域中相关系数使用很广泛,比如计算免疫评分与基因表达的相关性,计算模型风险得分与通路的相关性等等,今天这款小工具专注解决各种矩阵相关性问题,

摊已经摆好随时欢迎大家使用

网址导航

http://sangerbox.com/Tool 点击“矩阵相关性计算工具”

软件参数

01—示例

输入数据:两个变量之间计算相关性(如下图所示)

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展示结果

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02—示例

几个基因两两之间的相关性

输入数据

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展示结果

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03

示例

当有十几个基因两两之间的相关性时

输入数据

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展示结果

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04—示例

计算两个矩阵中数据之间的相关性

输入数据

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展示结果

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特别注意:

1.如果是以文件的格式将数据导入到云平台,平台默认无法读取Excel中的数据,必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件,否则小工具将无法运行。

2.将文件从本地上传到网站上应注意文件名只能用字母、数字或下划线命名不能有空格等特殊字符命名,否则将上传失败。

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