一个基因/样品如何画热图呢?
2021-03-22 本文已影响0人
数据可视化艺术
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/ebb81afa0299b2e5.png)
在科研数据分析中,我们往往是抽丝剥茧,希望找到几个,最好就是一个关键基因,比如我们想找易感基因、驱动基因、Marker基因等。当然功夫不负有心人,最终我们都可能如愿以偿!但后续如何把结果呈现出来,却要不知所措了:一个基因的数据该如何可视化?可以画热图吗?
一般的情况,我们画出来的图是这样的:
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/b0e47ac7e3b2d8a4.png)
如何完善上面的图呢?首先我想到的两个思路是,1. 把热图掰弯变成环形热图;2. 调整热图的图例及比例构成。那么如何实现呢? 接下来我们可以通过“派森诺基因云(https://www.genescloud.cn)”的“交互原值热图”进行实现。
1 准备数据
准备图2, 图3 所示数据,“交互原值热图”工具支持两种类型的数据。
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/ffc7face638128da.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/26d96d3906b11d7b.png)
2 提交绘图
上传数据后,一键提交绘图。
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/308b64fd4595972f.png)
3 参数调整
在图表调整里面,选择【图表设置→图表类型→圆形图】,除了对图表类型外,还可以对图表的颜色及图例等样式进行设置。
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/3e2fd75336e27749.png)
不同的数据结构,得到的图也不一样,如下所示:
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/f1615fa290ff2a32.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/497b9f92d189223c.png)
如果对上述图还有更加个性化的要求,大家可以下载pdf或者svg格式的图片,导入AI软件进行处理,比如调整字体、图例位置等。下面给大家分享一个图形换色的功能。点击AI软件【编辑→编辑颜色→重新着色图稿】,可以根据需要选择互补色、近似色等智能推荐方案,也可以自定义更改目前的颜色。
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/538db2271c1edbd9.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/62c63f5e31a2217e.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i23693924/d544d2785b6128eb.png)