Scater package 中的exprs的纠结

scater package应该是目前单细胞数据QC功能最为齐全强大的包了，然而在对数据集进行转换后，总会出现exprs 这一项，关于exprs value值的计算过程真是让我纠结了好久，下面贴出R Documentation中关于exprs转换的具体过程：

即当提供的原始数据集中有TPM或FPKM时，exprs=log2(TPM/FPKM+1),其他的情况(只有counts/CPM时)，exprs=log2(CPM+1).

真是信了这个Documentation 和scater vingette 的邪，

当我去对照自己的数据后，发现：仅有counts值时，exprs ≠log2(CPM+1)

多处查询无果，Google也没出来解答，最后竟然在bioconductor 下的bug reports发现惊喜：

第一句话真是让我怀疑狗生(ノへ￣、)

之后又去了作者的github答疑板块进行确认，发现在仅有counts的文件时，返回的exprs确实是log-(normalized)count values.

但目前对于normalized这一步的具体原理我还不是很清楚。

Tips:不要忽略bioconductor de bug reports 功能，毕竟你遇到的问题别人很可能都遇到过，与其在google中盲目搜索，不如这个网站更有针对性的回答来的更高效；

R 中很多包的功能很复合，一句话中数据可能做了多种处理转换，务必尝试尽量理解每一步的作用，原理。