2018-12-15日总结
2018-12-16 本文已影响9人
小梦游仙境
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细胞形态仍然是区分肿瘤实质内CAFs最可靠的方法,如常用的细胞标记物,如α-平滑肌肌动蛋白(SMA),成纤维细胞特异性蛋白1(FSP-1 / S100A4)或成纤维细胞活化蛋白(FAP)
单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一项技术创新,它克服了大量RNA测序数据中细胞亚群(bulkRNA-seq)的掩蔽,并允许研究单个细胞的转录组,目的是确定由类似转录推断的细胞亚群。
scRNAseq已被用于鉴定CAFs作为刺激Hedgehog的特异性应答者群体,而Hedgehog又将发起CAF诱导的癌症干细胞生态位
在这里,我们使用了高灵敏度的Smart-SEQ2协议划定的乳腺癌的遗传改造的MMTV-PyMT小鼠模型中分离768个的CAF的异质性。我们定义了三个转录多样的CAF亚群。值得注意的是,每个CAF子集通过表示不同功能的基因程序的表达清楚地区分,并且被证明在肿瘤实质内具有独特的空间位置。因此,我们的工作以单细胞分辨率剖析乳腺肿瘤中的CAF群体,并揭示肿瘤微环境中先前未被认可的功能多样性,为进一步开发精确医学工具开辟了道路。