R统计和作图生物信息学与算法高通量测序

易生信极高性价比暑期黑马集训 -- 低至2500每人

2018-07-10  本文已影响10人  生信宝典

开课背景

生物信息学说起来很好理解,可是对大部分想学习生信的人来说,操作起来却是有些棘手,无有头绪。生信的研究内容主要包括两个方面:首先,需要生物研究者利用实验收集、整理、储存、获取生物学数据;另一方面,需要依托数理信息科学的技术和方法管理和分析数据。如今工具开发者(IT)和工具应用者(Biologist)的界限越来越模糊,只要您是生信领域的工作者,都需要了解生物信息学分析基本知识。

生物学家产生数据的能力和兴趣是没有止境的,尤其随着现代测序技术的发展,生物数据的积累不断爆发。转录组是常用的分析解决生物问题的手段之一,如何做好转录组设计、分析转录组数据、解读转录组结果是必须的能力。Linux、Python、R是生物信息分析的三个程序基础,掌握基础原理和程序知识有助于我们提高转录组数据分析的效率。

生信学习是一个曲折的过程,但是只要你找准方向并坚持学习,就不难。为此,易生信在8月为大家推出一期连续5天的暑期线下课程,帮您清扫生信道路上眼花缭乱的障碍。本次培训课将从最基础的测序原理、数据挖掘入手,实践操作整套转录组数据的分析流程,让您有能力完成分析。然后再把流程拆解开,帮您实现自主定制分析和可视化。

课程安排

第一天 2018.8.8

  1. 高通量测序的应用、设计和案例分享
  2. 高通量测序原理、注意事项
  3. 转录组分析流程和结果解读
  4. Linux基础
  5. R基础

第二天 2018.8.9

  1. Linux软件安装套路和转录组分析软件自动安装
  2. 转录组分析实战和解读(比对、定量、差异、富集、WGCNA)

第三天 2018.8.10

Linux进阶-转录组分析流程的深入解读和结果转换提取

第四天 2018.8.11

R进阶-转录组数据挖掘和可视化(PCA,热图聚类,火山,富集图,箱线图等)

第五天 2018.8.12

Python编程实战-转录组分析结果提取和转换

您能学到什么

  1. 掌握二代测序原理和转录组项目设计、解读方法
  2. 掌握Linux、R和Python用于数据分析的技能
  3. 独立进行转录数据分析和解读的能力
  4. 转录组后续定制分析的能力
  5. 勤加练习即可快速入手同类分析方法

课程框架概览

转录组课程框架 Linux生信学习 R生信学习 Python生信学习

主讲老师

主讲老师包括中科院微生物所、遗传发育所、基因组所、生物物理所等多名本领域一线技术专家。

刘永鑫,博士,中科院遗传发育所,微生物组专家,致力于16S和宏基因组的研究和推广,运营有数十万关注度的《宏基因组》微信公众号。

陈同,博士,2015毕业于中科院遗传与发育生物学研究所,生物信息专业,在Cell Stem Cell,NAR等高水平杂志以第一作者或主要作者发表文章,运营有数万关注度的《生信宝典》微信公众号。

  1. Chen Tong, Hao Ya-Juan, Zhang Ying, Li Miao-Miao, Wang Meng, Han Weifang, Wu Yongsheng, Lv Ying, Hao Jie, Wang Libin, Li Ang, Yang Ying, Jin Kang-Xuan, Zhao Xu, Li Yuhuan, Ping Xiao-Li, Lai Wei-Yi, Wu Li-Gang, Jiang Guibin, Wang Hai-Lin, Sang Lisi, Wang Xiu-Jie, Yang Yun-Gui, and Zhou Qi. (2015) m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16, 289–301 (cover story)
  2. Cui Yi, Xiao Zhifeng, Chen Tong, Wei Jianshu, Chen Lei, Liu Lijun, Chen Bing, Wang Xiujie, Li Xiaoran, and Dai Jianwu. (2014) The miR-7 identified from collagen biomaterial based 3-D cultured cells regulates neural stem cell differentiation. Stem Cells and Development 23, 4: 393-405. (co-first author)
  3. Wu Hua-Jun, Ma Ying-Ke, Chen Tong, Wang Meng and Wang Xiu-Jie. (2012) PsRobot: a web-based plant small RNA meta-analysis toolbox. Nucleic Acids Research 40:W22-W28.

助教团队

十余名科学院、清华、北大硕士、博士,轮值讲师和助教,辅助学员学习和矫正教授过程中不足的点。

课程福利

  1. 赠送价值约3000元的Linux、R、Python、转录组视频和教案(按照报名内容赠送相应在线课)
  2. 报名后即可进入学习群,助教发布学习计划,提前熟悉基础知识
  3. 学习群一直保留,供大家交流解决问题
  4. 提供易汉博基因科技兼职助教机会、实习机会或工作机会
  5. 报名还有优惠政策(见下方)

课程价格

生信暑期班课程价格

最优惠价格:转发减500,五人同时报名各减500,赠送课程338,等同于2512元学习前两天的转录组。

时间地点

时间:

2018-08-08 到 2018-08-12 (五天线下讲解实战)

每天早9点到晚7点,半封闭式教学 报到时间:当天

地点:北京市西城区鼓楼明德大厦 (北京市旧鼓楼大街47号院2号)))

注意事项

  1. 需自备笔记本电脑,系统不限。课程实践需要会提供云计算平台
  2. 培训班所有数据,文档为内部资料,仅供参阅,未经允许不得翻印外传登刊
  3. 上课期间禁止录音,录像
  4. 成功付款的学员,若临时有紧急事情不能到来的,可申请延期,更换后续培训班;也可申请退款
  5. 若开课2周 (含) 前申请退款可退还85%费用;开课3个工作日 (含) 前申请退款退还70%的费用
  6. 不可先延期再退款

学习建议:

这次课程是把最开始的4门课程

(转录组、R、Python和Linux)

打包在一起的集中授课

前两天满足基本分析,后3天实现定制进阶

建议上课前听完赠送的视频课程(或视频节选),带着问题来

做的好这可能是你最后一次参加生信培训

报名网站: http://www.ehbio.com/Training

转录组研究

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