各种RNA分不清?看这篇文章就够了
dsRNA 双链RNA(double-stranded RNA, dsRNA) 是一种有互补链的RNA,与细胞中发现的DNA相似,dsRNA构成了一些病毒(双链RNA病毒)的基因组。像病毒RNA或siRNA之类的 双链RNA能够促发真核细胞中的RNA干扰,引起脊椎动物中的干扰素反应。 3、 shRNA:小发卡或短发卡RNA(a small hairpin RNA or short hairpin RNA, shRNA)是一段具有紧密发卡环(tight hairpin turn)的RNA序列,常被用于RNA干扰沉默靶基因的表达。利用载体把shRNA导入细胞,载体中的U6 启动子确保shRNA总是表达;这种装载了shRNA载体可被传递到子代细胞中去,从而使基因的沉默可被遗传。shRNA的发卡结构可被细胞机制切割成 siRNA,然后siRNA结合到RNA诱导沉默复合物上(RNA-induced silencing complex,RISC),该复合物能够结合到目的mRNAs并将其降解。shRNA 是由RNA 聚合酶Ⅲ转录的,哺乳细胞中的shRNA产物有时会促使细胞产生干扰素反应(细胞遇到病毒侵袭时做出的自我防卫反应),而miRNA中却不会遇到这种问题 (miRNA是由RNA聚合酶Ⅱ转录,与转录mRNA的聚合酶相同)。shRNA也被用于植物和其它系统中,在这些系统中不需要U6启动子的驱动。在植物 中,常用的增强表达的启动子是CaMV35S(cauliflower mosaic virus 35S),在这种情况下,RNA聚合酶Ⅱ参与了转录,起始RNA干扰。
Endo-siRNA 即内源性小干扰RNA (siRNA) ,是一类存在于几乎所有真核生物中的小干扰RNA 分子。
exo-siRNA即外源性小干扰RNA (siRNA) ,是指通过体内或者体外技术生成且生物基因组上不编码,能诱导基因沉默的一类小干扰RNA 分子。病毒感染或者实验方法导入的双链RNA 可以启动外源性小干扰RNA 的生成。
mi.RNA 是一类含有约22 个核苷酸的内源性小RNA , 存在于植物和动物体内。miRNA 由含有70 个核苷酸的发夹状前体经Dicer 酶作用而生成, miRNA 可以通过破坏靶mRNA 的稳定性、抑制靶mRNA 的翻译来对靶mRNA 发挥调控作用。
piRNA 是指piwi 相互作用RNA, 是一类内源性小干扰RNA, 能特异性地与动物细胞中Argonaute 蛋白的类似物PIWI 结合。PiRNA 不能由dsRNA 形成。
RNA 干扰(RNAi) 是由双链RNA 诱发的对目的基因表达的序列特异性沉默作用。
shRNA 即小发夹RNA , 是siRNA 或miRNA 的前体,包含一个19- 29 个核苷酸的"茎”和一个4~15 个核苷酸的“环”结构。shRNA 在转录后可以从细胞核转移至细胞质,在细胞质中其环结构被Dicer 酶切割, 释放出siRNA 。shRNA 可以自然生成,也可经人工制备并用作基因沉默的工具。
shRNAmir 即笫二代shRNA, 将siRNA 包裹于自然界生成的pre-miRNA 之中。与标准的shRNA 相比, shRNAmir 对靶mRNA 的沉默效率更高。
siRNA 即小干扰RNA , 是一种双链RNA, 长度为21~23 个核苷酸,其3’端含有两个突出的非配对碱基。siRNA 与RISC 结合后, 一条链即信使链被移除,另一条链即向导链则引导RISC 对互补的靶标RNA 分子实施切割和降解。
saRNA 即小型激活RNA,也是dsRNA的一种。saRNA具有基因激活功能,能够上调目的基因的表达。