生信星球培训第五十四期

学习小组Day5-Ju Chen

2020-04-22  本文已影响0人  Ju_4bdd

向量(Vector)

1. 向量定义

元素:数字或者字符串
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量,是一排有序排列的元素,是最基本的R语言数据对象,有六种类型的原子向量,包括逻辑,整数,双精度,复杂,字符和原始。

2. 向量的赋值:用c()函数进行赋值

> x<-c(1,2,3)
> x
[1] 1 2 3
> x<-1:10
> x
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
> x<- seq(1,10,by = 0.5)
> x
 [1]  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5
[15]  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
> x<-rep(1:3,times=2)
> x
[1] 1 2 3 1 2 3

查看所有被定义的向量

3. 访问向量元素:用[]建立索引,可对单个或多个元素进行查看.

3.1 根据元素的位置

> x<-c(1,2,3,4,5)
> x
[1] 1 2 3 4 5
> y<-1:10
> y
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
> z<-seq(1,10,by = 0.5)
> z
 [1]  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5
[15]  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
> x[3]
[1] 3
> z[4]
[1] 2.5
> z[5:8]
[1] 3.0 3.5 4.0 4.5
> x[c(2,4)]
[1] 2 4
> x[-c(2,4)]
[1] 1 3 5

3.2 根据元素的值

> x<-seq(1,10,by = 0.5)
> x
 [1]  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5
[15]  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
> x[x==10]
[1] 10
> x[x<5]
[1] 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5
> x[x %in% c(1,2,5)]
[1] 1 2 5

数据框

1. 数据框定义

数据框是一种特殊的列表对象,各列表成员由向量(数值型、字符型、逻辑型)、因子、数值型矩阵、列表等组成。

2. 数据框生成

使用data.frame()函数生成 (没有找到本地数据)

> X1
[1] "A" "B" "C" "D" "E"
> X2
[1]  1 NA NA  3 NA
> X<-data.frame(X1,X2)
> X
  X1 X2
1  A  1
2  B NA
3  C NA
4  D  3
5  E NA

3. 设置数据框行名和列名

> X
  X1 X2
1  A  1
2  B NA
3  C NA
4  D  3
5  E NA
> colnames(X)[1]<-"bioplanet"
> X
  bioplanet X2
1         A  1
2         B NA
3         C NA
4         D  3
5         E NA
> row.names(X) <- c("one","two","three","four","five")
> X
      bioplanet X2
one           A  1
two           B NA
three         C NA
four          D  3
five          E NA

4. 数据框的导出

write.table函数语法:
write.table (x, file ="", sep ="", row.names =TRUE, col.names =TRUE, quote =TRUE)
参数说明:
x:需要导出的数据
file:导出的文件路径
sep:分隔符,默认为空格(” “),也就是以空格为分割列
row.names:是否导出行序号,默认为TRUE,也就是导出行序号
col.names:是否导出列名,默认为TRUE,也就是导出列名
quote:字符串是否使用引号表示,默认为TRUE,也就是使用引号表示
原文链接:https://blog.csdn.net/u013421629/java/article/details/72771241

> View(X)
>  write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote = F)

5. 变量的保存与重新加载

> save.image(file = "bioinfoplanet.RData")
> save(X,file = "test.RData")
> load("test.RData")
image.png

6. 提取数据框中元素

> X[1,1]
[1] A
Levels: A B C D E
> X[1,]
    bioplanet X2
one         A  1
> X[,1]
[1] A B C D E
Levels: A B C D E
> X[1:2]
      bioplanet X2
one           A  1
two           B NA
three         C NA
four          D  3
five          E NA
> X[c(1,2)]
      bioplanet X2
one           A  1
two           B NA
three         C NA
four          D  3
five          E NA
> X$bioplanet
[1] A B C D E
Levels: A B C D E

7. 直接使用数据框中的变量

以下3种功能一样

> a <-data.frame(case=paste("S",1:50),values=runif(50))
> plot(a$case,a$values)
> attach(a)
> plot(case,values)
> with(a,{
+     plot(case,values)
+     x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了大括号仍有效。
+ })
Rplot.png

附今日思维导图一张

54th 学习小组Day5- Ju Chen R语.png
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