《生物软件及应用》课程笔记高通量测序技术

Aspera安装和配置

2018-10-15  本文已影响19人  晓明_再出发

Aspera是一项突破性传输协议,充分利用现有的 WAN 基础设施和通用硬件,传输速度比 FTP 和 HTTP 快达数百倍。

Aspera在Ubuntu环境的安装过程如下:

<h3>Step 1: 建立安装文件夹</h3>

mkdir ~/Biosofts
cd ~/Biosofts

<h3>Step 2: 下载Aspera软件</h3>

wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.6.2/aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz

<h3>Step 3: 解压文件</h3>
是tar.gz格式,用tar命令和zvxf参数

tar zvxf aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.tar.gz

<h3>Step 4: 安装Aspera</h3>
解压后是一个shell脚本,运行即可

sh aspera-connect-3.6.2.117442-linux-64.sh

<h3>Step 5:测试Aspera是否安装成功</h3>
ascp命令默认安装地址在:~/.aspera/connect/bin

~/.aspera/connect/bin/ascp -h

<h3>Step 6:将aspera安装路径加入环境变量</h3>

echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.bashrc

<h3>Step 7:使环境变量生效</h3>

source ~/.bashrc

<h3>Step 8:测试Aspera路径是否成功加入环境变量</h3>

ascp -h

运行结果:


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