生信星球培训第十二期

2019-01-19 R学习第五天 青萍之末 14李健豪

2019-01-19  本文已影响52人  青萍之末2333

一:R语言基础知识

1:关于R语言语法

(1):就像世间万物皆有各种各样的元素组成一样,组成数据的最基本的元素分为两种数字或者字符串(用chr表示),可用class函数定义。 2.png

如果,在一个封装函数的时候有一个chr就会都变成chr
(2):向量(示例来源生信星球)

x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意这里是逗号不是分号)
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

向量的提取(列的提取一样的)

> a[c(1:3)]
[1] "1"    "2"    "good"
> a[c(1,3)]
[1] "1"    "good"

文件的读取

a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a,读取文件,分隔符为Tab,有表头 

文件的合并转置(明天出增刊详细研究)

colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

数据导出(类似于read函数,会自动输出yu.txt文件

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)

散点图

c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))#case 列和values列的取法
attach(c)
plot(case,values)

也能做with循环

with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,y也就是出了with循环仍有效。
})x #运行完后打印x

with循环?问题
镇楼图

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