向量

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数据框

读取本地数据

x<-read.csv('doudou.txt')
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header = T)

sep参数：分隔符，默认为空格。
header参数：设置为TRUE时第一行作为列名。

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设置行名和列名

• X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
• colnames(X) #查看列名
• rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
• colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
• X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名;read.csv函数header参数默认为TRUE，不同于read.table。

数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）

变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

提取元素

• X[x,y]#第x行第y列
• X[x,]#第x行
• X[,y]#第y列
• X[y] #也是第y列
• X[a:b]#第a列到第b列
• X[c(a,b)]#第a列和第b列
• X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

直接使用数据框中的变量
散点图

options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)

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作业问题

• save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
  答：之前没有对X进行定义或者定义的时候没有区分大小写。
  解决办法：重新定义X。