今日，运行代码
出现错误;

Error in DataSetFromMatrix(countData = mycounts, colData = metadata, design = ~sample, :

没有"DataSetFromMatrix"这个函数

#构建 DESeq对象
library ("DESeq2")
dds <- DataSetFromMatrix(countData=mycounts, 
                         colData=metadata, 
                         design=~sample,
                         tidy=TRUE)
##出现报错：
Error in DataSetFromMatrix(countData = mycounts, colData = metadata, design = ~sample,  : 
  没有"DataSetFromMatrix"这个函数

百度：
BioConductor 结决 没有"DESeqDataSetFromMatrix"这个函数
按照他所说的方法，未能解决。
而且，很多是他衍生出来的文章，也不标注出处。最近的一个是2021.7.10。

最终在这找到了答案。

DESeq2 "DESeqDataSetFromMatrix" error

#DataSetFromMatrix改成：DESeqDataSetFromMatrix即可
#如下：
library ("DESeq2")
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData=mycounts, 
                         colData=metadata, 
                         design=~sample,
                         tidy=TRUE)

image.png

未报错，运行成功

感悟：多数文章一大抄，经不起验证。且未注明出处。这种行为很狗。

ps：转载此文须注明出处。