Linux命令
2022-08-02 本文已影响0人
与世无争的垃圾
| 是管道符
grep '>' ehbio.fa | wc -l 提取的字符作为输入到下一个命令,
输出为4(表示有4行序列) = grep -c '>' ehbio.fa
sed 's/ HAHA//' ehbio5.fa >xx.fa 去除HAHA字符
sed -i 's/ HAHA//' ehbio5.fa 去除HAHA字符但不在当前界面显示
sed 's/ HAHA//' ehbio5.fa | less 管道符使用下一步查看
!+命令词(如grep)自动输入之前命令
!! 返回上一个命令
!! :gs/5/2/ 把上一个命令里面出现5的换成了2
转换fastq为fasta,并按顺序重复命名序列
awk 'NR%4==2 {print ">E"NR/4+0.5"\n"$0}' example.fq > example.fa # 显示fasta文件末尾10行