Linux命令

2022-08-02  本文已影响0人  与世无争的垃圾

| 是管道符

grep '>' ehbio.fa | wc -l  提取的字符作为输入到下一个命令,

输出为4(表示有4行序列) = grep -c '>' ehbio.fa

sed 's/ HAHA//' ehbio5.fa >xx.fa 去除HAHA字符

sed -i 's/ HAHA//' ehbio5.fa  去除HAHA字符但不在当前界面显示

sed 's/ HAHA//' ehbio5.fa | less 管道符使用下一步查看

!+命令词(如grep)自动输入之前命令

!! 返回上一个命令

!! :gs/5/2/ 把上一个命令里面出现5的换成了2

转换fastq为fasta,并按顺序重复命名序列

awk 'NR%4==2 {print ">E"NR/4+0.5"\n"$0}' example.fq > example.fa # 显示fasta文件末尾10行

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