这本Nature旗下的6.4分SCI接收了经典的生信数据挖掘预后
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我们都在说现在基于数据库挖掘的预后模型文献已经烂大街了,然鹅!有人又默默的在一个 正统的6.4分杂志上发文章了,啥是正统呢?就是除外咱们耳熟能祥的经典灌水杂志。
2020年5月13日 英国诺丁汉大学医学院诺丁汉乳腺癌研究中心等单位学者发表的数据挖掘文章发现了一个: 基于两个基因的预后标签,影响因子 6.4分。
文章简介
这项研究旨在使用下一代测序技术来探查TNBC切除样品的转录组,以鉴定与疾病结果相关的新型生物标志物。文章应用了两个RNA-seq的 TNBC数据集,应用了 supervised artificial neural network analysis进行降维筛选预后相关的基因,接下来应用两个外部数据集验证这两个基因:Breast Cancer Gene-Expression Miner v4. 0 and Genotype 2 outcome datasets。
多变量Cox回归分析确定了与不良预后独立相关的预后基因特征。最后,通过使用免疫组织化学的蛋白质表达来证实两个基因的预后结果。人工神经网络确定了两个基因panel,能预测远处无转移生存和乳腺癌特异性生存。对两个panel共有的21个基因进行单变量Cox回归分析后发现,八个基因的表达水平与不良预后独立相关(p <0.05)。使用多因素Cox回归分析调整临床病理因素,包括患者的年龄,等级,淋巴结分期,肿瘤大小和淋巴管浸润,产生了两个基因的预后标签,其与不良预后相关(p <0.05),独立于其他预后变量。作者又进一步验证了这两个基因的蛋白表达,并以独立和组合方式与患者预后显着相关(p <0.05)。
小结一下
与常见的文章分析方案,仅仅是多了一步蛋白水平的验证,可是人家发了6.4分哦?