TCGA差异表达分析流程文章汇总

应该是比较全面的TCGA癌症基因差异表达分析流程
如果想自己实践一下，完全可以按照本系列文章的内容一步一步来，如果有不成功的地方，不妨共同探讨
TCGA基因差异表达分析流程(1)：https://www.jianshu.com/p/f51963f4643a
流程1对首先对TCGA网站做了比较全面的介绍，包括TCGA的数据内容，数据来源，数据管理方式。
其次介绍了如何利用R语言编写脚本获取TCGA的数据，下载到本地，并进行相应的数据编辑、转化，为下一步的基因差异表达分析做准备

TCGA基因差异表达分析流程(2)：https://www.jianshu.com/p/ae7bfa4f9ab4
流程2介绍了基因差异表达分析的一般流程，包括基因，lncRNA，miRNAD的差异表达分析，并绘制火山图，聚类图等进行数据可视化。

TCGA基因差异表达分析流程(3)：https://www.jianshu.com/p/e89bcb61cf08
流程3介绍了如何利用这些差异表达基因进行KEGG富集分析，GO分析，蛋白质互作网络分析。

当然，这些文章的内容还会陆续更新，因为水平有限，尚有不少错漏的地方，而且还有很多原理，细节操作，值得细细诉说。