生物信息

2bit文件转换为fa格式文件 2019-10-22

2019-10-22  本文已影响0人  夸克光子

处理数据时,需用到小鼠的基因组,于是在UCSC上面下载了小鼠的mm10基因组,但是是2bit格式,无fa文件,

不过说明中有提到2bit转换fa的方法,具体如下:

1、下载mm10.2bit文件

2、mm10.2bit 文件说明提到方法(如下),可以打开链接 http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/

3、之后下拉页面找到 twoBitToFa 文件下载

4、下载之后文件所在目录下直接终端输入命令:/home/wangyahao/文档/twoBitToFa mm10.2bit mm10.fa

‘ /home/wangyahao/文档 ’ 为 twoBitToFa 文件的所在路径

上一篇 下一篇

猜你喜欢

热点阅读