hisat2: 建立reference

建立Hisat2要求格式的reference

hisat2-build -p 4 genome.fa --snp genome.snp --ss genome.ss --exon genome.exon output.ref

-p : 线程数
--snp : SNP文件路径和文件名，可省略
--ss : Splice Site文件路径和文件名
--exon : 外显子文件路径和文件名

生成的八个ht2文件共同构成了同一个Index，不可分开使用