【R>>oncmineR】快速获取Oncomine页面数据

2021-05-19  本文已影响0人  高大石头

太长不看版:

save as MHTML浏览器插件下载网页内容,oncomineR提取页面内容。

操作流程

1.下载并安装save as MHTML到浏览器

2.安装oncomineR

devtools::install_github('yikeshu0611/oncomineR')
library(oncomineR)

3.登陆Oncomine网站,查找信息

以PTTG1为例,在Oncomine中查找到相应数据集。


将网页另存为mhtml格式

4.oncomineR::oncomine读取网页内容

 r <- oncomine("oncomine.org.mhtml")

柱状图57个样本的表达数据就这样轻松收入囊中,是不是很神奇?

示例

共表达基因分析



曾经帮师兄一点一点的记录这些数据,现在mama再也不用担心我做这些重复性的 工作了。衷心感谢树神!

不禁感叹:树神出品,必是精品!
参考链接:
oncomineR
oncomine 数据库及R包安装

上一篇下一篇

猜你喜欢

热点阅读