【R>>oncmineR】快速获取Oncomine页面数据
2021-05-19 本文已影响0人
高大石头
太长不看版:
save as MHTML
浏览器插件下载网页内容,oncomineR
提取页面内容。
操作流程
1.下载并安装save as MHTML
到浏览器
2.安装oncomineR
包
devtools::install_github('yikeshu0611/oncomineR')
library(oncomineR)
3.登陆Oncomine网站,查找信息
以PTTG1为例,在Oncomine中查找到相应数据集。
将网页另存为
mhtml
格式4.oncomineR::oncomine
读取网页内容
r <- oncomine("oncomine.org.mhtml")
柱状图57个样本的表达数据就这样轻松收入囊中,是不是很神奇?
示例
共表达基因分析
曾经帮师兄一点一点的记录这些数据,现在mama再也不用担心我做这些重复性的 工作了。衷心感谢树神!
不禁感叹:树神出品,必是精品!
参考链接:
oncomineR
oncomine 数据库及R包安装