Sentieon软件发布202112.06版本更新
2022-11-08 本文已影响0人
chSNP
Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型，在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下，计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案，可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling，无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据NGS分析效率和计算精度。
Sentieon持续为业界提供高性能的NGS数据分析软件。我们根据用户的需求与反馈，持续迭代改进Sentieon软件包，三代长读长的变异检测工具是我们近期开发的重点。2022年11月9日，Sentieon推出了最新的202112.06版本，具体更新信息如下：
202112.06版本主要新增功能如下：
- 新版添加了对 LocusCollector 和 Dedup 算法的支持，以执行涉及UMI barcode的重复数删除；
- 更新了Dedup模块算法，以支持对UMI barcode的纠错功能；
- 更新了GVCFtyper模块功能，用户可以将从多个测序平台获得的DNAscope gVCF合并到单个多样本VCF中；
- 在 GVCFtyper 中添加了对没有 PL 字段的 gVCF 文件的支持；
- 更新了LongReadSV算法，现在可以同时支持PacBio HiFi和Oxford Nanopore长读长数据处理。
修复BUG
- Solved issue in umi consensus that could cause a segmentation fault when input has 0-length read..
- Solved issue in GVCFtyper that would produce <NON_REF> alleles under rare circumstances..
- Solved issue that Plot GCBias was left-shifted on some datasets.
