• 大片段文库一般指片段长度1k以上的文库。

• 测序机器是选择小段的片段测序的。（illumina 为150bp）

• 文库构建是随机的。

  
  

大片段测序目的

• 获取reads之间的物理距离关系

大片段测序问题

• 无法PCR 太长的片段
• 只测序很短的序列，合成大片段浪费

应对方式

对于这样的问题，illumina 测序采取了特别的方式。
相比于小片段文库序列，大片段序列会进行环化处理（并对末端进行生物素标记）。

接着会对这段环状片段再进行打断。

接下来的处理就和小片段处理类似了。

小/大 片段文库

• 小片段文库read 为pairend，大片段文库read 为matepair。

• 两条序列方向不同。