在线作图|如何绘制一张山脊图

2021-08-24  本文已影响0人  维凡生物

山脊图(Ridgeline chart)

山脊图(Ridgeline chart)作为可视化图形的一种,可以研究不同群组的数值变量的分布情况,展示不同类别数据在同一因素的不同水平下的分布差异,分布可以用直方图和密度图表示,它们都对齐到相同的水平尺度,并以轻微的重叠来表示。

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TUTU网站工具使用

小编给大家介绍一个在线作图工具,绘制山脊图的方法如下:
①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(已经为大家填好了),输入验证码后即可登录;
③登录后在全部工具那一栏找到山脊图,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作~

上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据);
b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名或基因名(例如OTU,基因ID等等),每一行为某指标的具体数值。
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。


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参数设置

①绘图类型选择:常规、渐变


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②透明度:按需求自行设置
③线条形状选择:density_ridges、binline


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下载文件

点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

作图后处理

TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。

写作建议

XXXX analysis was performed on Tutools platform (https://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.

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