生信小笔记

Linux学习笔记(1)

2019-03-13  本文已影响2人  xianmao123

Linux 也是一个操作系统,和我们平常使用的windows、mac那些一样。 由于大多数生物信息分析的软件都是在 Linux 操作系统下运行的,所以学习生物信息的第一步就是从熟悉的windows等图形界面的操作系统过渡到熟悉使用Linux的一些基本操作。 此处应该注意对于Linux系统,我们需要的是“使用”,而不是“管理”或者“开发”这些。现有的网上搜索到的大多数 Linux 教程、书籍都是针对管理员和开发人员写的。 对于初学生信的我们来说过去复杂,这里整理归纳了一些目前我工作中常用的,在后续再对里面的命令详细阐述。

passwd:修改用户密码;

pwd:显示当前所在路径;

ls:列出当前目录里面的内容,可加上 -l -rt -h等参数,可以明确目录下都有什么文件,多大,权限如何等等详细的属性;

cd :跳至指定目录,这里常用的cd命令有:"cd -" 跳回上一次的目录,"cd .." 退回上级目录,“cd ~”跳回家目录; 

目录管理相关命令:

                              mkdir:创建目录;

                              rm:删除文件或者目录;

                              mv:重命名文件或者目录;

                              chmod:修改文件或者目录权限;

文件查看相关命令:

                              cat:查看文件,并将内容输出到屏幕,但是对于大文件不适用,会看不清内容;

                              tac:和cat相反,是从尾到头查看文件并输出;

                              less和more:这两个是查看大型的文件比较合适的方式;

                              head -n:查看文件前n行;

                              tail -n:查看文件尾n行;

                               wc -l:计算文本文件的行数;

 管道操作; cut;grep; awk; sed; sort;这几个比较复杂且重要,后续再详细展开说明用法。

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