《破天机:基因编辑的惊人力量》
珍妮佛·杜德娜 塞缪尔·斯滕伯格
22个笔记
上篇 工具
>> DNA的信息最终被翻译为蛋白质的序列,这个过程遵循的是分子生物学的中心法则。首先,在细胞核内,DNA转录出一个临时拷贝,叫作信使RNA(mRNA)。信使RNA是一条单链,它的序列跟DNA模板是对应的(一个重要的区别是T被换成了>> U)。然后信使RNA被运送到细胞核外
>> 呈递到核糖体(合成蛋白质的工厂),信使RNA上的碱基信息被翻译成氨基酸信息,也就形成了蛋白质。翻译的过程遵循的是遗传密码表:每3个碱基组成了一个三联体密码子,它对应于一个特定的氨基酸(由于密码子有64种可能,而氨基酸有20种,因此一个氨基酸可能对应于多个密码子,此外,还有3个终止密码子代表终止信号)。核糖体从信使RNA的一端开始,逐个密
>> 细胞还有第二套用于修复双链断裂的分子机制——同源重组,它比异常重组要更精确、更有分寸,因为它只对序列特别相似的DNA片段进行重组。事实上,早期的基
下篇 任务
>> 通过把CRISPR与其他遗传元件(比如抗病基因)组合起来,科学家不仅可以用CRISPR复制自身,而且能复制任何DNA序列
>> 研究人员面对的诸多难题包括:要选择何种类型的细胞进行基因编辑?是应该编辑体细胞,还是生殖细胞?这些正是当今医学界最重要的议题,也引发了最激烈的辩论
>> 更何况还要进入细胞内部。如何投递CRISPR?这是编辑体细胞的第一个巨大挑战。
现有的投递策略可以分为两大类:体内基因编辑,以及体外基因编辑
>> 在前者,CRISPR直接送到患者体内,等候它发挥效果;在后者,患者的细胞被提取出来,经过体外编辑之后再移植回体内。相对而言,体外编辑要更加容
>> 最有希望通过体外CRISPR疗法得到治疗的两种遗传病是镰状细胞病和乙型地中海贫血症,它们的病因都是血红蛋白的分子突变。
>> 基因编辑有可能解决这个问题,因为它用的是患者自身的干细胞,这样,患者既是供体,也是受体。如果医生从患者的骨髓里分离出干细胞,利用CRISPR修复其突变的乙型球蛋白基因,然后把编辑后的细胞输回患者体内,既不必担心供体来源的问题,也不必担心免疫排斥的问题。
>> 艾滋病毒攻击的正是人体的白细胞。正常情况下,白细胞表面的CCR5蛋白质是艾滋病毒入侵白细胞的几个关键部位之一,这些幸运儿的独特之处在于,由于CCR5基因内部缺失了32个碱基对,CCR5蛋白质出现了突变,变得更短了,这使得艾滋病毒无法在细胞表面“着陆”,因而无法感染细胞。
>> 一个办法是用CRISPR来靶向锁定艾滋病毒的基因,从患者的基因组中把入侵的DNA“揪”出来,从而保护患者不受艾滋病毒的威胁。另外一个办法叫作“激活并消灭”,它使用一种失活的CRISPR版本来主动唤醒休眠的病毒,然后再用现有的药物杀灭它们。
>> 首先,医生需要知道如何把CRISPR精确投递到病灶组织;其次,我们要保证这不会引起患者的免疫排斥反应;最后,Cas9蛋白质和向导RNA必须在人体内足够稳定,确保完成基因编辑。
>> 已经改造了许多特异性的病毒来向人体内投递DNA,而且不会感染宿主,因为它们的唯一功能就是运送研究人员装载上的治疗物质。
>> 用于投递遗传物质的病毒一般叫作载体。对体内基因编辑来说,一个特别有用的载体是腺相关病毒(AAV),这是一种无害的人类病毒。腺相关病毒会引起微弱的免疫反应,但不会导致任何疾病。这种病毒载体可以轻易地装载上治疗用的基因(包括编码Cas9和向导RNA的基因),而且可以把这些遗传物质有效投递到宿主细胞内。更重要的是,我们可以
>> 癌症始于DNA突变,有些是从出生时就有,有
>> 编辑最有潜力的一个应用是辅助近几年最受关注的一种疗法——免疫治疗。
免疫治疗是癌症治疗的一个革命性进展。它跟传统的癌症治疗方式,包括外科手术、放疗和化疗都有所不同,免疫治疗利用患者自身的免疫系统来围捕并杀死癌细胞,这称得上是一种典型的范式转移。
>> 癌症免疫治疗背后的核心观念是对
>> 人体免疫系统进行微调,特别是针对T细胞,这是免疫系统的大部队
>> 个潜在的突破是所谓“检查点抑制剂”(checkpoint inhibitors),这种药物可以阻断这种抑制作用,使免疫系统攻击癌细胞。另外一个办法是对T细胞进行遗传改造,使它们可以精确打击患者体内特定的癌细胞。其实这也是一种体外治疗,它叫作过继性T细胞疗法(adoptive cell transfer,ACT),正是在这里,基因编辑登上了舞台。
>> 过继性T细胞疗法的基本目的,是帮助T细胞更好地靶向锁定癌细胞。T细胞里引入了一个新的基因,它可以合成出一个新的蛋白质受体,这个受体经过特殊的设计,可以识别并靶向锁定癌症的分子标记。但是
注释
>> CRISPR全称为clustered regularly interspaced short palindromic repeats,指成簇的、规律间隔的、短回文、重复序列
对crispr CAS9的发现及未来前景和担忧的自序文,作者系这些事情的亲历者,我们的未来何其具有想象力~基因编辑在遗传病、免疫疗法上的应用还是令人期待