“小麦研究联盟”文章汇总

2018-07-03 本文已影响5人 Neal_Bio

我将过去一年的所有推送做了一个汇总，并大致分成了几类。现在回过头来一看，这算是一份很宝贵的材料，特别是对刚刚入学的新生来说。资料一多，查找就不方便，对于如何快速查找公众号的内容，我们在必看：更好的利用微信订阅号——我们出书了？里已经介绍过。再次阅读几个月之前写的东西，有时候会觉得当时怎么能想到这些，有时候一些观点已经发生了变化。不扯这么多了，下面按分类说一说1年来的推送的文章吧。

每周末的文献汇总，最早从17年的12月份开始，已经更新33周。如果从头开始看，可以发现这其中的变化。目前采用的形式也是不断修正形成的。我们提供了文献题目，PMID, DOI供检索，推荐使用Google，ncbi检索文献。如果是没有权限下载文献，试试sci-hub，最后实在下不到，可以在群里求助。摘要使用的是谷歌翻译，没有经过校正，目的只是辅助大家理解英文和快速筛选感兴趣的文献。

2018年第六周小麦文献推荐（2.11）——第二部分

2018年第10周小麦文献推荐（3.11）

2018年第11周小麦文献推荐（3.17）

2018年第12周小麦文献推荐（3.24）--之二

2018年第12周小麦文献推荐（3.24）--之一

2018年第13周小麦文献推荐（4.1）

2018年第14周小麦文献推荐（4.8）

2018年第15周小麦文献推荐（4.15）

2018年第16周小麦文献推荐(4.22)

2018年第16周小麦文献推荐（4.29）

2018年第17周小麦文献汇总（5.6）

2018年第17周小麦文献汇总(5.13)

2018年第18周小麦文献汇总(5.20）

2018年第19周小麦文献汇总（5.20）

2018年第20周小麦文献汇总（6.3）

2018年第21周小麦文献汇总（6.10）

周末二三事和2018年第24周小麦文献汇总（6.15）

2018年第25周小麦文献汇总（6.24）

育种方面的推送，几乎都是宋印明（麦S）老师写的博客。宋老师每周六的推送几乎都是一周内阅读量最高的，转发往往也很多。他对育种的思考都是来自于实践，博文传递的观点具有启发性。每个资深育种人或许都有自己的思考和经验，后面有机会会邀请和联系一些常年奋斗在一线的资深育种人员来谈一谈小麦育种的感悟，这种感悟不一定大而全，哪怕基于一个组合的感悟分享出来也是有益的。

好吃不过饺子

基因组选择育种？

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---陇育5号

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---西农529

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---恒进麦8号

国家农作物品种审定委员会关于印发《主要农作物品种审定标准（国家级）》的通知---附有小麦品种审定标准

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---瑞华麦523

优质麦育种方法

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---农大5181

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---宁麦26

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---德研16

【公示】2017年河南省52个小麦品种通过初审

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---徐麦35

面向北部冬麦区小麦育种，张先生有她的观点

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---克春10号

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---克春7号

【公示】2017年通过山东省初审小麦新品种公示

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---晋麦100号

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---品育8161

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---山农30号

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---山农28号

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---齐麦2号

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---俊达129

农业部公告第2547号之小麦审定品种介绍---中信麦9号

特殊情形下对小麦赤霉病防治和确保品种纯度的一点点提醒

水肥不是万能的——继续说小麦受“倒春寒”伤害后的没救儿

育种人应学会善于认识和利用别人的品种或材料

对小麦育种中大穗性状的再刍议

下面这个分类我叫做背景介绍，绝大部分是教科书没有的，很多是根据我们平常接触的东西整理而来。

RNA翻译的复杂性:不翻译、部分翻译、从头翻译及过度翻译

降落数值测试结果当成小麦面粉品质改变的标准有可能造成很大的浪费

啤酒与学术 | 遗传所王国栋研究组发现非活性查尔酮异构酶促进啤酒花黄腐醇生物合成

为什么小麦啤酒被称作“贵族啤酒”？

喝着啤酒，看着世界杯--一起来聊聊小麦与啤酒的故事

表观遗传学简介

小麦的生长和发育-1

下面这一部分我归为方法介绍这一类，很多都是告诉大家怎么做。这一部分很多时候需要大家跟着操作。但实际上，这很难。

序列mapping新选择：Magic-BLAST

NCBI推出blastp加速服务

基因表达模式聚类以及可视化

中国春三代测序的scffold序列可下载了

中国春三代序列在线blast

重磅：IWGSC发布基因组浏览器

Carthagene -遗传图谱构建软件

map gene to chromosome

在NCBI上blast野生二粒小麦基因组序列

使用R画Wilkinson图

不同于文氏图（Venn diagram）的另外一种展示姿势

从NCBI下载测序数据 | 也许是目前最详细的版本

（伪）从零开始学转录组：读文章拿到测序数据

文献下载-来自一位小伙伴的经验总结

SRA数据的下载以及在线blast--或许与你了解的不一样

逐步深入绘制热图

（伪）从零开始学转录组：了解参考基因组及基因注释

SRA快速转fastq---即多核版fastq-dump——另外找一枚小麦育种方面的童鞋

Ms1基因组重测序数据重分析--from sra to g.vcf.gz

小麦生信必备网站和数据库（一）

小麦生信菜鸟成长记（二）----高手请直接看第二部分

call variants from wheat RNA_seq

一文解决RT-PCR的统计分析

小麦生信菜鸟(三)----常见问题

傻傻分不清的t test

SPSS正态分布以及方差齐性检验以及Wilcox检验

小麦生信菜鸟(四)—基因表达数据库

小麦穗粒数转录组分析(一)

小麦穗粒数转录组分析(二)——SNP的筛选

如何根据模式模式作物拟南芥和水稻的基因序列寻找小麦里的直系同源基因

小麦生信菜鸟归来（五）—系列总结以及特异性引物设计

小麦穗粒数转录组分析(三)-----Fst的计算

原创小程序-让你的引物设计又快又准！

小麦穗粒数转录组分析(四)----使用plink进行关联分析

小麦穗粒数转录组分析(五)----LD map展示

小麦族多组学数据网站——设计基因组特异引物

基于SNP的PCR标记技术2-CAPS标记之一

IWGSCv1.0准确性如何？

还在race拿全长？

文献导读这一类，算是我们的重点，也是我们的最重要的特色。有些文献我们会加入自己的一些感悟和思考。对于不同的文献阅读策略不一样，如果需要认真研读一篇文章的话，要有自己的思考和总结，也许只有这样，我们才能写出一篇像样的综述吧。文献看不懂的地方可以留言，可以在群里提问。实际上无论是留言还是群里，很少看到有小伙伴就文献阅读方面提问题。有时候我发现群里的人越多，大家越沉默，反而是那些小点的群比较活跃。实际上大群的潜在价值更大，只是我们没有利用好。这就像我们花钱买了健身卡，却从来没有使用过。我们以前说过一个好问题比一个好答案更重要。这句话可以这样理解，有答案的问题是已经解决的问题，而没有答案的问题才是我们未来需要解决的。我们做科研就是需要解决未知的问题。学习最快的方式之一也许就是不断提问吧。我们可以注意观察周围的同学，那些经常发问的同学一定是进步最快的。

第一个接近完整的六倍体小麦基因组

野生二粒小麦基因组在science发布

麦瘟病(wheat blast)是什么鬼？

Plant Physiology同期发表4篇与小麦有关的论文

Pm21，掀起你的盖头来