Cut&Tag

2022-06-25  本文已影响0人  日月其除

和chip seq实验流程比较


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chip seq分析流程


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Cut&Tag实验流程


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参考网站:解锁新技术,玩转表观研究-CUT&Tag (baidu.com)

Cut&Tag分析流程:
官网:CUT&Tag Data Processing and Analysis Tutorial (yezhengstat.github.io)

关于比对使用--end-to-end 和local的一些解答:What does "25x25 PE Illumina sequencing" means and how does the reads length influence CUT&Tag? · Issue #3 · yezhengSTAT/CUTTag_tutorial · GitHub
call peaks使用的是SEACR: Sparse Enrichment Analysis for CUT&RUN
git网址:https://github.com/FredHutch/SEACR/blob/master/README.md

别人的重复的流程:水稻CUT&Tag数据分析流程 - 简书 (jianshu.com)

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