immunedeconv踩坑记录

2023-06-17 本文已影响0人小熊_wh

immunedeconv包号称可以利用多种算法进行免疫细胞比例计算，包括quantiseq、timer、cibersort、cibersort_abs、mcp_counter、xcell、epic、abis、consensus_tme、estimate这些算法。但是在实际使用中会碰到各种难题，首先是安装就麻烦，具体见免疫细胞估算R包immunedeconv安装，现在就具体几种算法遇到的问题一一记录。

1. mcp_counter