计算fastq中的reads数
2023-04-22 本文已影响0人
煮梦斋_bioinfo
fastq条数就是总行数/4,fasta条数就是数">"的个数
fastq
expr $(cat test.fastq | wc -l) / 4
fasta
grep ">" test.fasta | wc -l
fastq条数就是总行数/4,fasta条数就是数">"的个数
fastq
expr $(cat test.fastq | wc -l) / 4
fasta
grep ">" test.fasta | wc -l