计算fastq中的reads数

2023-04-22  本文已影响0人  煮梦斋_bioinfo

fastq条数就是总行数/4,fasta条数就是数">"的个数
fastq

expr $(cat test.fastq | wc -l) / 4

fasta

grep ">" test.fasta | wc -l

参考链接:https://www.jianshu.com/p/dbf09d1850b9

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