lncRNA其它数据库

2020-02-15  本文已影响0人  超级无敌大蜗牛

1.DIANA-LncBase v2——http://www.microrna.gr/LncBase

2.LNCediting——http://bioinfo.life.hust.edu.cn/LNCediting/

3.NPInter v3.0——http://www.bioinfo.org/NPInter/

4.lncReg——http://bioinformatics.ustc.edu.cn/lncreg/

5.LNCipedia v4.0——http://www.lncipedia.org

6.LncRNAMAP——http://lncRNAMap.mbc.nctu.edu.tw/

Lnc2Meth (http://www.bio-bigdata.com/Lnc2Meth/) 就是一个基于已有发表文献结果,对其中涉及到在特定研究疾病中的lncRNA及其甲基化结果进行了整理归纳收录的数据库。其中,对于每一个lncRNA都会提供DNA甲基化区域、类型和调控机制,而其是否在文献报道中有作为诊断分子以及其发表文献信息等都有整理。

lncSNP2.0 (http://210.46.80.146/lincsnp/search.php) 当仍不让的成为大家的首选工具,它是由华中科技大学研究人员开发的专门收录lncRNA和SNP关联信息的数据库,包含人和小鼠两个物种。

RegRNA2.0 (http://regrna2.mbc.nctu.edu.tw/index.html)  是由台湾同胞所研发的,专用来预测RNA功能性的motif序列,其预测内容包含转录motif、mRNA降解原件、RNA-RNA结合、翻译预测等功能。

参考链接:http://www.biotrainee.com/thread-2485-1-1.html

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