单细胞测序

百奥智汇开发的算法合辑

2022-01-20  本文已影响0人  Hayley笔记

总结一下在这里,有时间的话挨个学习一下

1. X: 原始数据处理算法,1h内生成表达矩阵
2. SciBet: 快速细胞分类算法,可高速处理多平台单细胞数据
3. STARTRAC: 细胞谱系示踪算法
4. E-test: 差异表达检测算法,准确分析细胞间差异表达基因
5. Affinity Embedding: 细胞相互作用评估算法,构建细胞互作网络图
6. CSOmap: 细胞空间关系预测方法,基于单细胞转录组数据预测细胞空间关系
7. MnnPy: 批次效应评估与校正算法,准确识别与校正批次效应
8. iMAP: 批次效应评估与校正算法,快速整合单细胞数据
9. ROGUE: 细胞类群纯度评估算法,识别亚群中细胞异质性
10. IDEA: 可变剪切分析算法,识别转录本可变剪切事件

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