绝大部分报错都应该是谷歌搜索解决

2018-12-26  本文已影响68人  因地制宜的生信达人

绝大部分报错都应该是谷歌搜索解决

最近在跟着jimmy大神的视频课程学习ChIP-seq数据,代码也是拷贝的大神的,如下:

conda create -n chipseq python=2
 source activate chipseq
 conda install macs2s

很简单就安装软件,而且很容易使用,如下:

macs2 callpeak -c IgGold.bam -t RYBP.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n RYBP

运行macs2的时候出现了报错,试了几种方法,把MACS单独安装在一个环境变量,升级下python3,结果都还是报错

经过直接面对面jimmy大神的协助,安装了libgfortran==1,进行版本降级

conda install libgfortran==1

然后成功debug

macs2 callpeak -c IgGold.bam -t ring1B.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n ring1B 2/ring1B.macs2.log

其实大神就是根据报错信息谷歌了一下而已。

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