TCGA / 癌症简称 / 缩写 / TCGA癌症中英文对照

   这期我们了解一下 TCGA 数据的癌种，以及简称，如何快速准确的定位到指定的数据！ 

01数据库选择

    我们如果想看数据信息，可以考虑  UCSC Xena (xenabrowser.net) ，在 hub 上可以看到各种类型的数据库，这里我们选择 TCGA Hub, 如下：

    进入页面后，我们发现 TCGA 数据库上对应的癌种的全称以及缩写，如下：

02 TCGA的癌症名称，简写和中文名称

    我们看到 TCGA 数据上 38 Cohorts, 715 Datasets，那么我这里给出 35 种癌种对应的中英文名称以及缩写，方便大家检索，以后对着列表找癌种即可，表格如下：

癌种    缩写    中文名称 

Adrenocortical Cancer    ACC    肾上腺皮质癌 

Bladder Cancer    BLCA    膀胱尿路上皮癌 

Breast Cancer    BRCA    乳腺浸润癌 

Cervical Cancer    CESC    宫颈鳞癌和腺癌 

Bile Duct Cancer    CHOL    胆管癌 

Colon Cancer    COAD    结肠癌 

Colon and Rectal Cancer    COADREAD    结直肠癌 

Large B-cell Lymphoma    DLBC    弥漫性大B细胞淋巴瘤 

Esophageal Cancer    ESCA    食管癌 

FFPE Pilot Phase II FPPP    FFPE    试点二期 

Glioblastoma    GBM    多形成性胶质细胞瘤 

lower grade glioma and glioblastoma    GBMLGG    胶质细胞瘤 

Head and Neck Cancer    HNSC    头颈癌 

Kidney Chromophobe    KICH    肾嫌色细胞癌 

Kidney Clear Cell Carcinoma    KIRC    肾透明细胞癌 

Kidney Papillary Cell Carcinoma    KIRP    肾乳头状细胞癌 

Acute Myeloid Leukemia    LAML    急性髓系白血病 

Lower Grade Glioma    LGG    脑低级别胶质瘤 

Liver Cancer    LIHC    肝癌 

Lung Adenocarcinoma    LUAD    肺腺癌 

Lung Cancer    LUNG    肺癌 

Lung Squamous Cell Carcinoma    LUSC    肺鳞状细胞癌 

Mesothelioma    MESO    间皮瘤 

Ovarian Cancer    OV    卵巢癌 

Pancreatic Cancer    PAAD    胰腺癌 

Pan-Cancer    PANCAN    泛癌 

Pheochromocytoma & Paraganglioma    PCPG    嗜铬细胞瘤和副神经节瘤 

Prostate Cancer    PRAD    前列腺癌 

Rectal Cancer    READ    直肠癌 

Sarcoma    SARC    肉瘤 

Melanoma    SKCM    皮肤黑色素瘤 

Stomach Cancer    STAD    胃癌 

Testicular Cancer    TGCT    睾丸癌 

Thyroid Cancer    THCA    甲状腺癌 

Thymoma (THYM)    THYM    胸腺瘤 

Endometrioid Cancer    UCEC    子宫内膜样癌 

Uterine Carcinosarcoma    UCS    子宫癌肉瘤 

Ocular melanomas    UVM    眼部黑色素瘤

这样就很清楚了，数据选择也是文章开始的重中之重，您选对数据集了没？

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