BEAUti v1.10.4分歧时间估计2023-08-11

2024-08-18  本文已影响0人  土雕艺术家

https://kns.cnki.net/kcms/detail/11.5840.Q.20190415.1851.010.html

导入矩阵数据和引导树

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设置节点,为后续约束树形和添加化石分歧时间做准备。
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跳过Tips Traits 因为没有使用端点和特征,位点设置中选择模型
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选择分子钟
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选择树以及树形先验概率
Tree Prior一般使用Speciation: Yule Process 或者Speciation: irth-Death Process
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Priors设置
这一步添加设置节点的分歧时间


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选择正态分布更没有严格边界


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Operators设置
这里我一般用默认设置


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最后mcmc设置运行代数、抽样频率


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