生信/物相关软件（2）

这里所提及的软件，均是我在学习过程中遇见了，用过的软件。如果有更好的平替软件，希望各位推荐给小弟哦！

1. Cytoscape -信号通路分析软件

Cytoscape加载界面
这是做蛋白互作网络分析常用的软件，
建议到官网直接下载安装哦，
软件的使用率很高，到浏览器中随手一搜就是满满的使用教程，so，慢慢搜吧~

最后推荐两个插件：

• 寻找hub基因 -插件cytohHubba；

• 寻找子网络，寻找每个子网络的hub基因，插件Mcode；

  
  插件安装

2. FunRich-基因功能分析工具

FunRich加载页面
全称就很屌的样子：FunRich —— Functional Enrichment analysis tool；（用完发现他值得）
能画Venn图，能做heatmap，
GO，pathway样样行，
还不放过网络图！
最后还能转换ID，以及miRNA相关分析，
如果您需要，还能在FunRich，UniProt，Gene Ontology，Reactome以及Custom五个数据库中来回切换。
FunRich界面
看看这界面，都有点怀疑自己为啥要学R语言(╯▽╰ )好香~~

3.ImageJ-强大的科研绘图软件

界面简答，占地小，功能强！

ImageJ界面
个人认为这是个可以和PS抢生意的绘图软件。
不仅能完成western blot的灰度分析，提取图片信息，免疫组化分析，还能进行荧光照片的合并、分割，明场图片白平衡，背景校正等等。
功能丰富还操作简单，某乎已经有人将教程整理成册，可以学起来啦！
教程指路：https://zhuanlan.zhihu.com/c_1069243926476673024

4.GetData Graph Digitizer - 图出数据

这是个可以从数据图中读取数据值的软件，在写文献或论文时，总能遇见自己的结果忘记标数据，或者数据图不够美观，需要重新做数据图，而你又记不清原始数据，这时就可以使用这个软件，从数据图中读取数据值。
但，科研是个求真的事情，请合理使用软件功能哦！

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2020.09.21