1.linux登录

• 软件 xhell xftp
  xhell用来登录linux服务器，xftp用来上传文件

• xhell的用法

  
  图1

• xftp的用法

  
  图2

2.linux的语言

（继续昨天的学习），更新中。。。

• 快速查看文件：cat file1，使用于小文件
• 查看文件行数：wc -l file1,l是line的意思
• 查看文件前几行head file1,默认查看前6行，head -n 100 file1，查看前100行
• 查看文件末尾几行：tail file1，同head，tail -n 100 file1
  -逐页查看文件内容：more或者less，more file1或者less file1
  按空格键或者f向下翻页
  按b向上翻页
  按q退出
  （file1是要查看的文件名）
• cut提取某个特定列的信息，cut -f 1,2,3,4,5,6 test.gtf,就是提取test。gtf文件的第1、3、4、5列的信息，cut在不指定分隔符的时候是tab分隔，-d可以指定，如cut -d "," -f 1,3,4,5 test.csv
• 符号>:定向输出指定文件，如果文件不存在就创建文件；如果文件存在，替换其原本内容
  head file1 >head.txt,把file1的前6行内容输出到head.txt文件下
• 符号>>:输出内容追加到目标文件中，如果文件不存在就创建，如果存在就在旧内容后面追加新内容。
  tail file1 >> head.txt，把file1的后六行追加到head.txt中
• grep,文本搜索，grep -n"gene"hg19.gtf查看hg19.gtf文件中含有gene字符串的行，-n显示这些行的行号。
• chmod：change mode，文件或目录权限对象：u（user用户）、g（group同组用户）、o（other其他用户），+增加权限，-去除权限，=重新设定。
• 后台运行，screen，可以去休息挂起，服务器继续做任务，

screen -S session_name           # 新建一个叫session_name的session
screen -ls（或者screen -list）   # 列出当前所有的session
screen -r session_name           # 回到session_name这个session
screen -d session_name           # 远程detach某个session
screen -d -r session_name        # 结束当前session并回到session_name这个session
进入screen窗口后，想暂时退出（等会还想连接这个screen窗口）
crtl+a+d
退出当前screen窗口，结束当前screen窗口，不想再连接回来（即杀死会话）
exit或者ctrl+d

• which查看想看文件的路径，查找文件

总结

每天学一点，继续加油

更新中。。。